生物质锅炉在长期停用的时候，需要十分注其炉体外部的防腐蚀保养的问题，首先其锅停炉冷却后，在进行使用时必须要彻底清除热面的积灰和炉排上部、炉体下部的灰渣。然后要保持烟道有一定的自然通风。一般情况下，为了防潮应在炉膛、烟道中放置干燥剂。如以生石灰作为干燥剂，则每立方米炉膛或烟道内一般应放置3kg左右。放置后应严密关闭所有的通风门。生石灰变粉后要更换。如生物质锅炉房位置低洼，停炉期间地面泛潮严重时，则应采用经常小火烘烤和放置干燥剂相结合的办法。如果生物质锅炉停炉时间很长，在彻底清除烟灰后在炉体金属外表面涂以红丹油或其它防腐漆。
生物质锅炉的干法保养时要注意以下几点问题：干燥剂不要直接接触生物质锅炉金属表面，可装在铁盘等容器内放置干燥剂后，要关严手孔和其它孔盖，汽、水管道上的阀门必须截断生石灰变粉应及时更换。
生物质锅炉湿法保养时，要注意炉水最好用凝结水，其次可用原有的炉水，再次是软化水加碱后，炉水用微火加热至80-100℃压力升至2-3表压后保护2-3小时，使其循环达到炉水碱度均衡，压力降低时，再把炉水加满，造成1.5 4表压，并在整个保养期间一直保持这’碱度应定期化验，降低时，应随时补充冬天湿法保养要注意防冻，特别是排污通道和省煤器部分生物质锅炉重新使用前应全部放出锅内碱水最好备储液池，以利再用。同时须用净水冲洗。
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